snapgene mac版本 v4.3.6

SnapGene mac版是一款功能非常强大的分子生物学软件，它模拟了Clontech的In-Fusion克隆技术，只需选择您想要融合的DNA片段，即可设计引物，是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法，该软件还简化了吉布森装配反应的计划，并自动化了底漆设计，通过PCR扩增待连接的DNA片段以产生重叠末端，同时还能够非常直观的注释分析和DNA图谱，用于创建和共享丰富的注释文件,帮助我们准确清晰地为分子生物学绘制相关图形。

除此之外，SnapGene软件还可以方便教师和专门的学生来分析酶切位点、标签、启动子、终止子和复制子等质粒元件，并且还可以将数据导出为与设计用于DNA序列的其他流行软件解决方案兼容的文件格式，甚至还提供了计划，可视化和记录DNA克隆和PCR的最快和最简单的方法，用户可以轻松注释功能并设计引物，这种分子生物学工具可以生成详细的 DNA 序列文件，并与同事共享，有需要的朋友欢迎前来下载。

功能介绍

一、想象

1、DNA可视化

查看DNA序列的多个视图。

地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史

自定义酶位点，特征，引物，ORF，DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。

2、大序列支持

浏览染色体大小序列。

查看 · 搜索 · 缩放

利用SnapGene的高效数据处理功能，扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。

3、蛋白质可视化

查看蛋白质序列的多个视图。

地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史

自定义区域，站点，键和序列颜色的显示。

4、直观的序列编辑

轻松编辑DNA和蛋白质序列。

标准编辑 · DNA结束

进行插入，删除，替换和大小写更改。复制并粘贴序列时，会自动传输功能。

5、序列颜色编码

将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。

给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。

6、特征注释

自动注释常用功能，或手动注释新功能。

自动特征检测 · 手动特征注释

使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库

二、模拟

1、限制性站点指标

确认限制性网站适合克隆。

独特性 · 甲基化***性 · 特殊性质

以粗体显示独特的限制性位点，或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。

2、限制性克隆

可视化克隆过程的所有方面。

如果您已经考虑过程，则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷，则可以捕获并纠正错误。

3、PCR

模拟标准PCR。

使用您自己的引物，或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。

4、重叠延伸PCR

通过重叠延伸PCR融合片段。

最多可组装八个片段。选择要连接的片段及其方向，SnapGene将设计引物。

5、引物定向诱变

使用诱变引物进行定点诱变。

选择诱变引物，按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。

6、网关®克隆

模拟网关® BP克隆或lr克隆，或两者在同一时间。

为方便起见，提供了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段，SnapGene将设计引物。

7、吉布森大会®

通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。

选择要融合的片段及其方向，SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。

8、IN-FUSION ®克隆

通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法，可用于创建无缝基因融合。

选择要融合的片段及其方向，SnapGene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。

9、TA和GC克隆

通过TA或GC克隆捕获PCR产物。

选择传统的TA克隆或高效GC克隆。

为方便起见，提供了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。

10、退火Oligos

退火两个寡核苷酸形成双链产物。

使用简单的控件添加突出限制克隆。

三、避免错误

1、阅读基因融合的框架

确保构造中的已转换要素符合框架。

链接翻译 · 警告信息使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样，翻译链接在同一行。如果不是，则翻译在单独的行上。

2、与参考序列对齐

使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。

四、自动录制

1、全面的“撤销”能力几乎撤消任何操作。

不要害怕尝试使用SnapGene文件 - 回溯您的步骤很容易。

2、历史和嵌入式祖先

查看构造的图形历史记录。

单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分，或单击PCR引物名称以查看引物序列。

单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件，包括其注释和克隆历史记录。

3、历史色彩

使用可选的历史记录颜色来标识序列的最新更改。

详细了解构建体的组装方式，包括结扎的粘性末端。

五、有你的数据

1、安全文件管理

将SnapGene文件保存在所需的位置。

使用熟悉的安全操作系统来存储和整理SnapGene文件。

2、从其他格式导入

阅读许多常见的文件格式。

不仅可以导入DNA序列，还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商，以确保您不会被锁定为专有文件格式

3、导出为标准格式

将序列，地图或凝胶图像转换为标准格式，以便与其他软件一起使用。

将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。

4、使用SnapGene Viewer共享数据

将SnapGene格式的文件发送给可以下载免费SnapGene Viewer的同事或客户。

只需将文件与链接一起发送到SnapGene Viewer即可。收件人将能够看到地图，序列和注释，就像在完整的SnapGene界面中一样。

六、转换文件格式

开放式信息交换至关重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了读取和导出常见文件格式的选项。

软件特色

1、设计更好的程序

准确设计和模拟克隆程序。测试复杂的项目，在错误发生之前发现错误，并在第一时间获得正确的构造。

2、可视化您的流程

当您可以看到自己在做什么时，克隆会更容易。直观的界面为您提供无与伦比的工作可见性，简化通常复杂的任务。

3、自动记录您的工作

软件自动记录文档，因此您不必这样做。查看并分享导致最终质粒的每个序列编辑和克隆程序。

更新日志

v4.3.6版本

4.3版增加了多个新功能，包括重叠群装配，更灵活的比对工具，支持切口内切核酸酶，以及支持点特征。

1、重叠群大会

线性或环状重叠群可以从重叠序列或Sanger序列迹线重新组装。

2、灵活的对齐

现在可以以各种方式导入要对齐的序列。可以提取多个对齐的一部分以生成新的多重对齐，或者可以编辑现有的多个对齐以添加或移除由不同算法生成的对齐。

3、Nicking Enzymes

可以显示Nicking核酸内切酶。当选择跨越从线性序列的末端到切口核酸内切酶位点时，可以通过按Delete删除该单链区域。

4、点特征

现在，DNA序列支持零长度点功能，并在从GenBank，MacVector或Gene Construction Kit导入文件时识别。

5、酶网站突出显示

常用的酶位点可以用黄金突出显示，以便快速识别。

6、协调一致性增强

多重比对的共识序列具有改进的格式，现在可以复制或导出。

7、用于与参考序列对齐的存储编辑

根据流行的需求，当通过调整比对序列的端点编辑与参考DNA序列的比对时，保留和恢复那些编辑。

8、从其他文件格式导入功能

可以将特征导入到BED，GFF3或GTF格式的DNA序列中。

9、从UniProt导入

可以从UniProt数据库导入蛋白质序列记录。

10、进口基因组编译器项目

现在可以在SnapGene中直接打开Genome Compiler项目文件（.gcproj）。对于施工项目文件，在“历史记录”视图中捕获施工历史。

11、引物添加日期

将引物添加到文件时，会记录日期。引物可按添加日期排序。

12、读取和写入对齐文件格式

SnapGene可以导入比对以在SAM / BAM和参考序列矢量NTI® .cep格式，并且可以比对导出到SAM / BAM格式的参考序列。